沐鸣娱乐


        Gaussian入门(三)—模型建立(高斯建模)

        • 有单晶结构:从cif文件建立
        • 无单晶结构:GaussView建模
        • ChemOffice建模

        一、GaussView简介

        1、GaussView的功能

        • Gaussian的配套可视化工具
        • 计算模型的建立
        • 输入文件的建立
        • 结果的可视化
        • 轨道图形的查看
        • 振动模式的归属
        • 光谱结果的查看

        Gaussian入门(三)---模型建立(高斯建模)

        2、GaussView注意事项

        不建议用Calculate向Gaussian提交计算任务

        • 有冗余坐标
        • 有些非必须关键词
        • 输出信息并未指定

        Gaussian入门(三)---模型建立(高斯建模)

        二、从cif文件建立模型

        1、单晶数据来源

        • CCDC官网查询已有的单晶结构下载 https://www.ccdc.cam.ac.uk/
        • 离线软件CSD下载
        • 最新的文献报道的单晶
        • X-射线单晶衍射

        2、步骤

        • 用diamond等打开cif文件,取出结构单元
        • 保存为.mol,.mol2文件格式
        • 用GaussView打开再保存为.gif文件

        3、从ChemOffice建模

        • 使用ChemDraw建立平面结构
        • 导入Chem3D显示3D结构
        • 保存为.mol2格式
        • 使用GaussView打开 ,保存为.gif格式

        关注公众号《跟小王学习DFT》,第一时间获取更多科研干货与资讯。

        相关新闻

        联系我们
        联系我们
        分享本页
        返回顶部

          XML地图